21世纪(🤠)初，人(rén )类将多数人留在被(bèi )哥斯拉蹂躏的地(dì )球上，仅使被选(💠)中的人们乘上恒星间移民船(🤖)·阿拉特拉(lā )姆(🤘)，前往(💝)能够移(🏉)居的“约定(dìng )之(zhī )地(dì )·τ星e”。但这一计划失败，人类只得再度返回地球。而长距(🐡)离亚(🤔)空间(jiān )航行所引发的时空歪曲，导致人(🥅)类(lèi )回到的地(🏴)方(🚲)变成了“两(liǎng )万(👄)年后的(de )地球”。在(zài )(🌸)这个(gè )地球，主人公·晴男等人在(🚻)遭受哥斯拉(lā )袭击的同时(shí )，与(📬)埃(āi )(✖)克(kè )西弗、比尔(ěr )沙(shā )(🍹)尔德两种族(zú )(🈺)的异星(🔮)人共同实(🔬)行谋划了20年的“对哥斯拉战(zhàn )术”，通过殊死(sǐ )(🛌)战斗(dòu )成功击(jī )倒了哥(👆)斯(sī )拉。
　　但喜悦(🍑)并(⏫)未(wèi )持续多(duō )久(⤴)，深藏地下的真正(🚰)哥斯拉(🐁)“哥斯拉·地球(🛳)”现身了。两(liǎng )万(🌛)年(nián )间持续成长生存(🏰)、身高300米、质量超过10万吨(dūn )，在进化(huà )(❔)成(🐺)这种姿态的超(chāo )巨(jù )(⤴)大哥(🛰)斯拉压倒(🗻)性的(de )破坏力面前(qián )，晴男(nán )(🗒)等人落(luò )(🕎)花流水。
　　(🥖)拯救(🈁)了晴(🚑)男的是被视为人(rén )(🧔)类(lèi )的残存者(🔛)“弗图亚”之(🔼)民(mín )，米亚娜。弗(fú )图亚(yà )是他们(men )在这(🐕)个地球(🧀)首次遇(🍵)到(dào )的(🌨)人型生(🎓)命种族。他们会是人类的子孙吗——。“弗(💍)图亚(yà )的神也被哥(🏹)斯(sī )拉击破，如今(📔)只剩(shèng )(✨)下(xià )卵。挑战者、抗争者，全部(bù )被火(🔓)焰吞(tūn )噬而消(🀄)失了”面对(🐉)这样的(✏)他们，晴男回应(🍙)道(📲)“这(zhè )是以人类(lèi )(🍯)的(🔙)双手夺(duó )回(huí )地球(💳)的(👲)最后机会了”。
　　另一(yī )方(🕠)面，比尔沙尔(ěr )德的指挥官(guān )·加尔格，注意到(dào )弗图亚使用(⏳)的(de )箭头是由“自律思考金(jīn )属体·纳米(🎎)金属”所制造而欢喜。这和(🎳)21世纪他们在富士(🏝)山(shān )麓作(zuò )(🎾)为“对(📪)哥斯(🐆)拉决(jué )(🛬)战兵器”所(suǒ )开(😌)发、在启动前(qián )遭到破(pò )坏(huài )的“机(🌔)械哥(gē )斯拉”由同种物质(🤼)所(😒)构成。这正(💘)是当时的(de )开发设备(bèi )至今仍然(rán )残存的(🐢)证明(míng )——。